Метагенез (др.-греч. μετα- — «между», «после», «через» и γένεσις — «происхождение», «возникновение») — преобразование осадочных горных пород при погружении в литосферу под действием высоких температуры и давления в присутствии минерализованных растворов.

Одна из стадий литогенеза. Наступает после катагенеза и предшествует метаморфизму. Отличается от катагенеза тем, что охватывает породу целиком, а не отдельные её компоненты.

В ходе метагенеза происходят перекристаллизация аутигенных минералов и глинистого вещества, растворение одних минералов и кристаллизация других, в том числе основных породообразующих. В частности, глинистые минералы превращаются в слюду, гидроксид алюминия — в корунд, гидрогётиты — в гематит. Слоистость горных пород при метагенезе нередко сохраняется.

В результате метагенеза получаются метаморфизированные осадочные породы (промежуточные между осадочными и метаморфическими). На раннем этапе метагенеза это, в частности, глинистые сланцы, песчаники, кварциты, кристаллические известняки, антрациты; на позднем — аспидные и филлитоподобные сланцы.