En bacteriología: la palabra bacilo se usa para describir cualquier bacteria con forma de barra o vara,^[1]​ y pueden encontrarse en muchos grupos taxonómicos diferentes tipos de bacterias. Sin embargo el nombre Bacillus, se refiere a un género específico de bacteria. El otro nombre Bacilli; hace referencia a una clase de bacilos que incluyen dos órdenes, uno de los cuales contiene al género Bacillus.

Los bacilos son bacterias que se encuentran en diferentes ambientes y solo se pueden observar con un microscopio.

Los bacilos suelen dividirse en el mismo plano y son solitarios, pero pueden combinarse para formar diplobacilos, estreptobacilos y cocobacilos:

• Diplobacilos: Dos bacilos dispuestos uno al lado del otro.
• Estreptobacilos: Bacilos dispuestos en cadenas.
• Cocobacilos: Ovalados y en forma de bastoncillo.

Por tipo de bacteria los bacilos pueden ser:

• Bacilos Gram positivos: fijan el cristal violeta (tinción de Gram) en la pared celular porque tienen una gruesa capa de peptidoglucano.
• Bacilos Gram negativos: no fijan el cristal violeta y se tiñen con el colorante de contraste usado en la tinción de Gram que es la safranina, debido a que tienen una fina capa de péptidoglucano en medio de dos bicapas lipídicas en la cual se encuentran los lipopolisacáridos o también llamados endotoxinas (principalmente en la membrana externa).

Aunque muchos bacilos son patógenos para el ser humano, algunos no hacen daño, pues producen algunos productos lácteos como el yogur (lactobacilos).