Las Brigadas de los Mártires de Al-Aqsa es un grupo armado palestino vinculado al Tanzim, que a su vez es la rama militar del movimiento político Fatah. Las Brigadas nacieron con el estallido de la Segunda Intifada (también conocida como Intifada de Al-Aqsa) en el año 2000, tras los enfrentamientos del 29 de septiembre en la Explanada de las Mezquitas de Jerusalén. El nombre de este grupo está relacionado con la Mezquita de Al-Aqsa (Árabe المسجد الاقصى, Masjid Al-Aqsa), situada en Jerusalén, a pesar de ser, como Fatah, un movimiento laico.

Tras la muerte de Yasser Arafat el 11 de noviembre de 2004, el grupo anunció que firmaría sus ataques en nombre de las Brigadas de Shahid Yasser Arafat. Las Brigadas de los Mártires de Al-Aqsa, están vinculadas a Fatah, pero gozan de gran autonomía, y están compuestas por decenas de grupos armados diseminados por Cisjordania y, con otros nombres, en la Franja de Gaza.

Es importante no confundir las Brigadas de los Mártires de Al-Aqsa con Fuerza 17 (guardia personal del líder palestino Yasser Arafat)^[1]​ y la Policía Civil Palestina. Las Brigadas de los Mártires de Al-Aqsa es un grupo voluntarios y por lo tanto nunca ha tenido una lista oficial de afiliados.

El grupo está construido por células independientes para proteger a los miembros de ser descubiertos por las autoridades policiales israelíes. Desde el arresto en 2002 de su fundador, Marwan Barghuti, las Brigadas de los Mártires de Al-Aqsa no ha tenido un jefe indiscutible, ni de su calibre. Algunos grupos locales como los que actúan en Yenín o en Nablus, en el norte de Cisjordania, son como Hamás, con el que a veces colaboran en atentados o ataques.